16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0987 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0987  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  626  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0877  hypothetical protein  79.01 
 
 
269 aa  438  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10630  hypothetical protein  38.97 
 
 
156 aa  99  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00481692  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4384  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3219  hypothetical protein  32.28 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00235005  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12060  hypothetical protein  32.19 
 
 
349 aa  60.1  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1511  hypothetical protein  29.14 
 
 
264 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0874  hypothetical protein  26.67 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1638  hypothetical protein  24.48 
 
 
267 aa  54.3  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0257299 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1535  hypothetical protein  27.56 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1537  hypothetical protein  27.56 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4053  hypothetical protein  29.91 
 
 
266 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0808  hypothetical protein  28.91 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01640  hypothetical protein  25.36 
 
 
212 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.298419  normal  0.6279 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18010  hypothetical protein  28.26 
 
 
99 aa  45.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000611728  normal  0.273057 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3319  hypothetical protein  27.27 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>