19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1511 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1511  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  530  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4053  hypothetical protein  70.16 
 
 
266 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4384  hypothetical protein  37.16 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3219  hypothetical protein  31.41 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00235005  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12060  hypothetical protein  31.65 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0808  hypothetical protein  31.37 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10630  hypothetical protein  38.53 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00481692  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3319  hypothetical protein  33.58 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3307  hypothetical protein  32.85 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0987  hypothetical protein  27.23 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176553 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01640  hypothetical protein  32.54 
 
 
212 aa  59.3  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.298419  normal  0.6279 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0874  hypothetical protein  25.53 
 
 
274 aa  57  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1638  hypothetical protein  25.41 
 
 
267 aa  56.2  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0257299 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1537  hypothetical protein  32.19 
 
 
302 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1619  hypothetical protein  25.62 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.631243  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1535  hypothetical protein  32.19 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0877  hypothetical protein  23.59 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18010  hypothetical protein  40.28 
 
 
99 aa  49.7  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000611728  normal  0.273057 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0781  hypothetical protein  28.49 
 
 
290 aa  42.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0308662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>