18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4403 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4403  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  735    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.683762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0117  SpoIID/LytB domain protein  39.57 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1562  hypothetical protein  27.69 
 
 		 430 aa  62.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000976159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2039  SpoIID/LytB domain protein  31.46 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000207562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2014  SpoIID/LytB domain protein  31.46 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4218  sporulation protein SpoIID-like  37.04 
 
 		 384 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000195999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4515  SpoIID/LytB domain-containing protein  36.11 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1780  SpoIID/LytB domain protein  37.5 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0502  SpoIID/LytB domain protein  37.38 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1714  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.5 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2437  SpoIID/LytB domain protein  37.5 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.712007  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1802  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.5 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.806202  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1599  hypothetical protein  28.09 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.899582  normal  0.526265 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1794  SpoIID/LytB domain protein  34.48 
 
 		 720 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0642  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.5 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0335731  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0197  SpoIID/LytB domain protein  39.08 
 
 		 538 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2012  stage II sporulation protein D-like  38.61 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.703242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3247  SpoIID/LytB domain protein  38.64 
 
 		 443 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>