25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1562 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1562  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  860    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000976159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1563  Peptidase M23  55.79 
 
 		 353 aa  113  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000282199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0117  SpoIID/LytB domain protein  30.19 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5136  stage II sporulation protein D  25.27 
 
 		 339 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5528  stage II sporulation protein D  25.27 
 
 		 339 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5543  stage II sporulation protein D  24.69 
 
 		 339 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00744425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5462  stage II sporulation protein D  24.73 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000156076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4986  stage II sporulation protein D  24.73 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.579357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2257  hypothetical protein  48.94 
 
 		 474 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.091778 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5407  stage II sporulation protein D  29.37 
 
 		 339 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1599  hypothetical protein  33.05 
 
 		 361 aa  47.4  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.899582  normal  0.526265 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5084  sporulation stage II protein D  27.97 
 
 		 339 aa  47  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5411  stage II sporulation protein D  24.73 
 
 		 339 aa  47  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0080939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4968  stage II sporulation protein D  27.97 
 
 		 339 aa  46.6  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0719716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1802  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.93 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.806202  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4403  hypothetical protein  27.68 
 
 		 358 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.683762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5377  stage II sporulation protein D  27.97 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000599037 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  36.21 
 
 		 625 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3805  sporulation stage II protein D  29.23 
 
 		 337 aa  45.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2376  stage II sporulation protein D  26.26 
 
 		 291 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1118  SpoIID/LytB domain protein  23.97 
 
 		 463 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.819333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0087  sporulation protein and related proteins  29.03 
 
 		 309 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00338057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4787  SpoIID/LytB domain protein  29.45 
 
 		 313 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0506  SpoIID/LytB domain-containing protein  25.83 
 
 		 366 aa  43.5  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.133427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2928  hypothetical protein  36.49 
 
 		 257 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>