86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1563 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1563  Peptidase M23  100 
 
 		 353 aa  721    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000282199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1562  hypothetical protein  54.46 
 
 		 430 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000976159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  36.27 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  36.27 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  30.3 
 
 		 318 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2189  M23/M37 peptidase domain-containing protein  34.23 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  32.14 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  29.7 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  28.81 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  37 
 
 		 446 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.28 
 
 		 554 aa  53.9  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  37.5 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  29.66 
 
 		 547 aa  52.8  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  36 
 
 		 491 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  35.35 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  36 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  37.76 
 
 		 439 aa  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  31.45 
 
 		 465 aa  49.3  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1772  M23/M37 familypeptidase  33.33 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0592  M23/M37 familypeptidase  34.95 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.181185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  29.25 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  37 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  37 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  35 
 
 		 443 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06251  M23/M37 familypeptidase  29.51 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0447795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  37 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  29.55 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  37 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  37 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  37 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  37 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  36 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  37 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  37 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  37 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  37 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  37 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  37 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  29.1 
 
 		 446 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  37 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  35.64 
 
 		 460 aa  47  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  35 
 
 		 286 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  34.65 
 
 		 295 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1291  M24/M37 family peptidase  26.6 
 
 		 397 aa  46.2  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0497924  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1411  M24/M37 family peptidase  26.6 
 
 		 397 aa  46.2  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  36.36 
 
 		 271 aa  46.2  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  30.94 
 
 		 266 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  28.1 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0450  M24/M37 family peptidase  26.6 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.226008  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  34.34 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  34.69 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0465  Peptidase M23  31.48 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.817942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.83 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  30.97 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  26.05 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0330  Peptidase M23  29.71 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0430576 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  29.33 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  32.32 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  35 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  28.28 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  30 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  26.85 
 
 		 296 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  30 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  34.69 
 
 		 507 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  32.69 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  30.21 
 
 		 300 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  29.27 
 
 		 320 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0255  peptidase M23B  29.7 
 
 		 305 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  28.12 
 
 		 404 aa  43.1  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  27.82 
 
 		 464 aa  43.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  34 
 
 		 263 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  35 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  32 
 
 		 372 aa  43.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  36 
 
 		 293 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  35.35 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  35 
 
 		 288 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  32 
 
 		 305 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  34.38 
 
 		 268 aa  43.1  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44932  predicted protein  34.44 
 
 		 280 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996526  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  35 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  35 
 
 		 288 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  35 
 
 		 344 aa  43.1  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  34.34 
 
 		 400 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  30.97 
 
 		 282 aa  42.7  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  30.09 
 
 		 306 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3811  peptidase, M23/M37 family  34.34 
 
 		 204 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000746797  unclonable  9.38185e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>