16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2508 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2508  hypothetical protein  100 
 
 
649 aa  1305    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0564678  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2505  hypothetical protein  32.82 
 
 
768 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4276  hypothetical protein  24.95 
 
 
735 aa  95.5  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00531849  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0994  hypothetical protein  29.35 
 
 
515 aa  86.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1027  hypothetical protein  28.99 
 
 
515 aa  84.7  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2725  hypothetical protein  26.95 
 
 
698 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01280  hypothetical protein  30.51 
 
 
576 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.292249  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2617  unknown, LphB  28.2 
 
 
547 aa  61.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2744  unknown, LphB  28.79 
 
 
546 aa  57  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1415  hypothetical protein  23.81 
 
 
902 aa  54.3  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133763  hitchhiker  0.0024826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0165  arabinosyltransferase AftB  26.09 
 
 
667 aa  48.9  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20892  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5397  hypothetical protein  26.9 
 
 
676 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71515  normal  0.180581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1411  hypothetical protein  21.72 
 
 
303 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00357704  normal  0.0994638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5016  hypothetical protein  26.9 
 
 
676 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.978148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5104  hypothetical protein  26.9 
 
 
676 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13839  transmembrane protein  26.47 
 
 
627 aa  44.3  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240396  normal  0.0556328 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>