20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2156 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2156  HEAT domain containing protein  100 
 
 		 922 aa  1793    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.710014 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  27.22 
 
 		 1148 aa  67.4  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.33 
 
 		 1181 aa  62.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.23 
 
 		 1343 aa  62.4  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  25.72 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  28.57 
 
 		 958 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.32 
 
 		 510 aa  57  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  28.94 
 
 		 320 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1094 aa  53.5  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  23.77 
 
 		 644 aa  52  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.49 
 
 		 666 aa  51.2  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.67 
 
 		 490 aa  50.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  25 
 
 		 1224 aa  49.7  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4513  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.09 
 
 		 208 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.283819  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  26.59 
 
 		 501 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  35.37 
 
 		 321 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  28.57 
 
 		 838 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  23.35 
 
 		 546 aa  45.8  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.75 
 
 		 395 aa  45.1  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  33.08 
 
 		 428 aa  44.7  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>