18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4184 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4184  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  711    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2287  hypothetical protein  31.25 
 
 
413 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.10433  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3255  hypothetical protein  26.04 
 
 
278 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1300  peptidase C2 calpain  48.33 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2586  hypothetical protein  48.33 
 
 
424 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000365583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3530  hypothetical protein  55.74 
 
 
365 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000817362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3914  hypothetical protein  49.18 
 
 
382 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3912  hypothetical protein  47.54 
 
 
407 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3562  hypothetical protein  54.1 
 
 
145 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000216898  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3851  hypothetical protein  44.83 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1275  hypothetical protein  50.94 
 
 
436 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0739014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2584  hypothetical protein  44.83 
 
 
328 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000192335  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2853  peptidase C2 calpain  40.35 
 
 
361 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0973219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3251  hypothetical protein  37.31 
 
 
456 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0229094  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3448  peptidase C2 calpain  40.74 
 
 
360 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0447153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3253  hypothetical protein  38.98 
 
 
419 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000295877  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4519  hypothetical protein  43.64 
 
 
424 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000498589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2570  hypothetical protein  24.88 
 
 
948 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.0000805341  decreased coverage  0.000000145037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>