13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2570 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2570  hypothetical protein  100 
 
 
948 aa  1923    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.0000805341  decreased coverage  0.000000145037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1240  hypothetical protein  41.71 
 
 
896 aa  605  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153635  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0576  hypothetical protein  41.84 
 
 
761 aa  419  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.0000228174  normal  0.476347 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0399  hypothetical protein  41.24 
 
 
830 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00317128  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4381  hypothetical protein  40.08 
 
 
839 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.0000556116  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5833  hypothetical protein  40.79 
 
 
700 aa  355  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0185  hypothetical protein  39.39 
 
 
820 aa  347  6e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164712  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3819  hypothetical protein  39.66 
 
 
380 aa  182  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3275  hypothetical protein  45.11 
 
 
252 aa  105  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0171399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3815  hypothetical protein  29.14 
 
 
817 aa  102  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.888105  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3791  hypothetical protein  23.87 
 
 
829 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.805476  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4184  hypothetical protein  25.66 
 
 
339 aa  57.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2287  hypothetical protein  30.3 
 
 
413 aa  48.9  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.10433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>