32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3448 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3448  peptidase C2 calpain  100 
 
 
360 aa  749    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0447153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2853  peptidase C2 calpain  66.39 
 
 
361 aa  457  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0973219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1300  peptidase C2 calpain  37.8 
 
 
384 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0117  peptidase C2 calpain  32.18 
 
 
598 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0216  hypothetical protein  47.62 
 
 
145 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.350758  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4450  peptidase C2, calpain  29.91 
 
 
279 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1275  hypothetical protein  47.47 
 
 
436 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0739014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3257  hypothetical protein  47.87 
 
 
335 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00599549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4519  hypothetical protein  47.37 
 
 
424 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000498589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3851  hypothetical protein  44 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1886  peptidase  29.54 
 
 
827 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3253  hypothetical protein  38.32 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000295877  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2586  hypothetical protein  42.31 
 
 
424 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000365583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3912  hypothetical protein  36.89 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29736  predicted protein  35.94 
 
 
474 aa  69.7  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.692446  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27173  predicted protein  35.94 
 
 
474 aa  69.7  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.295693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3914  hypothetical protein  40.59 
 
 
382 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3251  hypothetical protein  37.61 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0229094  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10513  calpain-like protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07970)  27.59 
 
 
834 aa  63.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2584  hypothetical protein  32 
 
 
328 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000192335  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0483  hypothetical protein  27.2 
 
 
3754 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.38288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5424  hypothetical protein  30.43 
 
 
567 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.328963 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16523  predicted protein  27.49 
 
 
823 aa  57  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2576  hypothetical protein  35.35 
 
 
102 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000689075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3530  hypothetical protein  39 
 
 
365 aa  56.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000817362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3562  hypothetical protein  38 
 
 
145 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000216898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2379  hypothetical protein  22.96 
 
 
365 aa  53.1  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03130  hypothetical protein  28.06 
 
 
277 aa  52.8  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1055  thiol protease  27.27 
 
 
481 aa  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.048651 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45234  predicted protein  27.04 
 
 
935 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19510  Calpain family cysteine protease  25.93 
 
 
258 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524935  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00256  Calpain-like protease palB (EC 3.4.22.-)(Cysteine protease palB) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00204]  25.85 
 
 
847 aa  46.2  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0894791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>