23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3914 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3914  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  786    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3912  hypothetical protein  42.86 
 
 
407 aa  296  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4519  hypothetical protein  48.42 
 
 
424 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000498589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3851  hypothetical protein  43.24 
 
 
333 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2584  hypothetical protein  39.22 
 
 
328 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000192335  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1275  hypothetical protein  41.58 
 
 
436 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0739014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1300  peptidase C2 calpain  41.18 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2586  hypothetical protein  39.45 
 
 
424 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000365583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3530  hypothetical protein  46.3 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000817362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3562  hypothetical protein  45.87 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000216898  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2853  peptidase C2 calpain  39.39 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0973219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3257  hypothetical protein  44.9 
 
 
335 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00599549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3448  peptidase C2 calpain  40.59 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0447153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0216  hypothetical protein  39 
 
 
145 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.350758  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2576  hypothetical protein  38 
 
 
102 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000689075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3251  hypothetical protein  38.78 
 
 
456 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0229094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5399  hypothetical protein  28.98 
 
 
453 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000193647  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3253  hypothetical protein  34.69 
 
 
419 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000295877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0271  acyl-CoA dehydrogenase-like  27.43 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4184  hypothetical protein  49.18 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7535  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.17 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0558  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.66 
 
 
386 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.58726  normal  0.0406105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0482  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.55 
 
 
386 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>