32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2853 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2853  peptidase C2 calpain  100 
 
 
361 aa  749    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0973219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3448  peptidase C2 calpain  66.67 
 
 
360 aa  495  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0447153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1300  peptidase C2 calpain  35.9 
 
 
384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4519  hypothetical protein  49.47 
 
 
424 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000498589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3851  hypothetical protein  41.32 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0117  peptidase C2 calpain  31.5 
 
 
598 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0216  hypothetical protein  42.57 
 
 
145 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.350758  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3257  hypothetical protein  43.88 
 
 
335 aa  89.4  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00599549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1275  hypothetical protein  42.31 
 
 
436 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0739014  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4450  peptidase C2, calpain  30.41 
 
 
279 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2586  hypothetical protein  43.36 
 
 
424 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000365583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3912  hypothetical protein  39.32 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1886  peptidase  29.69 
 
 
827 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3253  hypothetical protein  34.86 
 
 
419 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000295877  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3914  hypothetical protein  38.39 
 
 
382 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3251  hypothetical protein  36.45 
 
 
456 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0229094  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2584  hypothetical protein  31 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000192335  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3530  hypothetical protein  36.94 
 
 
365 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000817362  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0483  hypothetical protein  27.53 
 
 
3754 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.38288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03130  hypothetical protein  31.7 
 
 
277 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10513  calpain-like protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07970)  27.75 
 
 
834 aa  57  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3562  hypothetical protein  35.14 
 
 
145 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000216898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5424  hypothetical protein  31.4 
 
 
567 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.328963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2576  hypothetical protein  32.32 
 
 
102 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000689075  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29736  predicted protein  30.36 
 
 
474 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.692446  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27173  predicted protein  30.36 
 
 
474 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.295693 
 
 
-
 
NC_002950  PG1055  thiol protease  28.63 
 
 
481 aa  50.4  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.048651 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45234  predicted protein  24.85 
 
 
935 aa  49.7  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16523  predicted protein  26.67 
 
 
823 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19510  Calpain family cysteine protease  26.11 
 
 
258 aa  46.6  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524935  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0619  hypothetical protein  21.89 
 
 
393 aa  46.6  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2379  hypothetical protein  31.51 
 
 
365 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>