46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0624 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0624  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
273 aa  558  1e-158  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0813093  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1282  oxidoreductase domain protein  36.09 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000882586  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  30.11 
 
 
317 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  27.66 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  28.92 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 
317 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 
315 aa  53.9  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  31.9 
 
 
320 aa  53.5  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.97 
 
 
345 aa  52.8  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  30 
 
 
353 aa  52.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 
360 aa  52  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 
355 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  26.9 
 
 
356 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 
355 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  28.9 
 
 
354 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 
344 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  30.63 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  26.87 
 
 
346 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0093  oxidoreductase domain-containing protein  22.76 
 
 
310 aa  47  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 
327 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.86 
 
 
317 aa  46.6  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 
326 aa  46.2  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 
337 aa  46.2  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  20.99 
 
 
334 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  21.31 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  23.76 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 
364 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  28.07 
 
 
340 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  24.9 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1519  hypothetical protein  30 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  27.33 
 
 
327 aa  43.5  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  27.33 
 
 
327 aa  43.5  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  24.9 
 
 
340 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  25.44 
 
 
335 aa  43.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 
328 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  24.6 
 
 
334 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.75 
 
 
332 aa  42.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.88 
 
 
310 aa  42.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0717  oxidoreductase domain-containing protein  27.39 
 
 
343 aa  42.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.75 
 
 
318 aa  42  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>