22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0149 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0149  ATP synthase, Delta/Epsilon chain, beta-sandwich domain protein  100 
 
 		 77 aa  153  6e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.339871 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1122  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.38 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1308  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  43.1 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19120  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  34.85 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509644  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10040  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  39.66 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2172  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.100722 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0971  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.68 
 
 		 135 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18391  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.68 
 
 		 135 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6913  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.85 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2604  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  32.73 
 
 		 94 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000410324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.7 
 
 		 86 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6135  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 		 121 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0503  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.84 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0445749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2337  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  32.73 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000264962 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08190  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  41.51 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.115051  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15581  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.09 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.82 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.711596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1523  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.29 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000221531  unclonable  1.83775e-19 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.26 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2447  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  38.6 
 
 		 91 aa  40.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.121306  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4010  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  31.82 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597874 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1938  ATP synthase F1 subuint epsilon  32.76 
 
 		 137 aa  40  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.787383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>