14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0080 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0080  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000158051 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1591  hypothetical protein  50.45 
 
 		 224 aa  231  5e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2239  hypothetical protein  37.14 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.731738 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2819  hypothetical protein  36.32 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00945968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33560  hypothetical protein  35.64 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0369  hypothetical protein  32.55 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0208  hypothetical protein  31.6 
 
 		 219 aa  127  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0298  hypothetical protein  33.96 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3430  hypothetical protein  39.29 
 
 		 211 aa  117  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.79074 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07410  hypothetical protein  35.64 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06930  hypothetical protein  33.02 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3349  hypothetical protein  32.54 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0382084  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01670  hypothetical protein  34.21 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3691  hypothetical protein  36.43 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>