14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33560 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_33560  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  380  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264856  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2819  hypothetical protein  75.25 
 
 
199 aa  288  4e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00945968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0298  hypothetical protein  73.74 
 
 
209 aa  262  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3430  hypothetical protein  57.79 
 
 
211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.79074 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0369  hypothetical protein  48.44 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2239  hypothetical protein  48.08 
 
 
219 aa  179  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.731738 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0208  hypothetical protein  46.35 
 
 
219 aa  178  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3349  hypothetical protein  57.45 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0382084  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1591  hypothetical protein  40.38 
 
 
224 aa  156  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06930  hypothetical protein  53.89 
 
 
211 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0080  hypothetical protein  35.64 
 
 
217 aa  144  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000158051 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07410  hypothetical protein  41.97 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3691  hypothetical protein  44.62 
 
 
189 aa  111  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19217  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01670  hypothetical protein  42.21 
 
 
224 aa  98.6  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>