14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2239 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2239  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  438  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.731738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33560  hypothetical protein  48.08 
 
 
199 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264856  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2819  hypothetical protein  48.57 
 
 
199 aa  158  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00945968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0298  hypothetical protein  47.69 
 
 
209 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3430  hypothetical protein  43.54 
 
 
211 aa  155  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.79074 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0369  hypothetical protein  37.04 
 
 
219 aa  148  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0080  hypothetical protein  37.14 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000158051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0208  hypothetical protein  36.11 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1591  hypothetical protein  36.65 
 
 
224 aa  136  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06930  hypothetical protein  42.18 
 
 
211 aa  128  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07410  hypothetical protein  37.2 
 
 
208 aa  109  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3349  hypothetical protein  37.02 
 
 
222 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0382084  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01670  hypothetical protein  37.5 
 
 
224 aa  102  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3691  hypothetical protein  38.52 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>