14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3691 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3691  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  363  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19217  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3349  hypothetical protein  56.96 
 
 
222 aa  155  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0382084  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0369  hypothetical protein  49.18 
 
 
219 aa  155  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0208  hypothetical protein  53.8 
 
 
219 aa  154  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33560  hypothetical protein  45.39 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264856  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2819  hypothetical protein  47.33 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00945968 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3430  hypothetical protein  45.66 
 
 
211 aa  124  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.79074 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0298  hypothetical protein  46.01 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06930  hypothetical protein  45 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1591  hypothetical protein  43.15 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07410  hypothetical protein  37.99 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2239  hypothetical protein  37.25 
 
 
219 aa  106  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.731738 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0080  hypothetical protein  36.62 
 
 
217 aa  100  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000158051 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01670  hypothetical protein  45.67 
 
 
224 aa  90.5  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>