14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06930 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_06930  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2819  hypothetical protein  51.26 
 
 
199 aa  170  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00945968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33560  hypothetical protein  53.89 
 
 
199 aa  169  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264856  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0208  hypothetical protein  44.08 
 
 
219 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0298  hypothetical protein  53.55 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0369  hypothetical protein  44.08 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3430  hypothetical protein  54.11 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.79074 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2239  hypothetical protein  42.18 
 
 
219 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.731738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3349  hypothetical protein  49.02 
 
 
222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0382084  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1591  hypothetical protein  41.18 
 
 
224 aa  135  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0080  hypothetical protein  33.64 
 
 
217 aa  122  6e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000158051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3691  hypothetical protein  45 
 
 
189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19217  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01670  hypothetical protein  46.26 
 
 
224 aa  109  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07410  hypothetical protein  39.38 
 
 
208 aa  105  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>