53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2777 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2777  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  155  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0388254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2457  hypothetical protein  74.67 
 
 		 75 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0636  hypothetical protein  73.33 
 
 		 77 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0579  protein of unknown function UPF0153  65.33 
 
 		 76 aa  104  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000485137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0592  protein of unknown function UPF0153  65.33 
 
 		 76 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00030944 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0219  protein of unknown function UPF0153  54.55 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0119  hypothetical protein  55.22 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.226036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3767  hypothetical protein  53.7 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4195  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0876839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1658  hypothetical protein  51.85 
 
 		 84 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2510  hypothetical protein  46.77 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0872529  normal  0.87408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29830  hypothetical protein  46.3 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4110  hypothetical protein  46.3 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3519  hypothetical protein  48.15 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2192  hypothetical protein  45.9 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.583182  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2002  hypothetical protein  45.9 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.786219  normal  0.232569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4337  hypothetical protein  44.26 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.306758  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1006  hypothetical protein  45.16 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0038  hypothetical protein  44.26 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0042  protein of unknown function UPF0153  44.26 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000233524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3749  Fe-S-cluster domain-containing protein  46.67 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3703  hypothetical protein  49.12 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0356  hypothetical protein  43.64 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0447585 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2450  protein YeiW  43.4 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0381641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2404  hypothetical protein  43.4 
 
 		 84 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.594721  hitchhiker  0.0000312382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2359  protein YeiW  43.4 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000642497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4222  hypothetical protein  45.9 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0035  hypothetical protein  43.86 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2428  protein of unknown function UPF0153  45.76 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0575  hypothetical protein  35.8 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000579653  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2091  protein of unknown function UPF0153  42.62 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0939789  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4475  hypothetical protein  45.61 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000150782  decreased coverage  0.00000000228641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4882  hypothetical protein  44.83 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44090  putative Fe-S-cluster oxidoreductase  45 
 
 		 84 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0353  protein of unknown function UPF0153  41.1 
 
 		 85 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0115675  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0038  hypothetical protein  38.27 
 
 		 84 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.304383  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3673  protein of unknown function UPF0153  47.17 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0608  protein of unknown function UPF0153  43.64 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00802731  normal  0.548911 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0649  protein of unknown function UPF0153  43.64 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572845  normal  0.0906583 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0040  hypothetical protein  38.27 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.140935  hitchhiker  0.000251454 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1510  hypothetical protein  44.83 
 
 		 109 aa  40.8  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423377  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0046  hypothetical protein  43.86 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000739222 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3912  hypothetical protein  41.67 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3121  proteinase inhibitor  44.83 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0044  hypothetical protein  46.3 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4025  hypothetical protein  43.1 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90654  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0365  hypothetical protein  33.87 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.759593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2331  protein of unknown function UPF0153  42.62 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2040  hypothetical protein  44.83 
 
 		 110 aa  40  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.321846  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3094  hypothetical protein  44.83 
 
 		 109 aa  40  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0740  hypothetical protein  44.83 
 
 		 110 aa  40  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2170  hypothetical protein  44.83 
 
 		 109 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.298759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2573  hypothetical protein  44.83 
 
 		 109 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>