50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0119 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0119  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  200  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.226036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0219  protein of unknown function UPF0153  68.6 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2457  hypothetical protein  56 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2777  hypothetical protein  55.26 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0388254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0636  hypothetical protein  53.33 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0579  protein of unknown function UPF0153  48 
 
 		 76 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000485137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0592  protein of unknown function UPF0153  48 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00030944 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0272  hypothetical protein  45.9 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2510  hypothetical protein  45.16 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0872529  normal  0.87408 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3912  hypothetical protein  51.06 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0603  hypothetical protein  40.48 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0856  hypothetical protein  44.16 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3252  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2775  hypothetical protein  49.12 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2696  hypothetical protein  49.12 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44090  putative Fe-S-cluster oxidoreductase  43.55 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2359  protein YeiW  39.29 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000642497  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2041  hypothetical protein  37.21 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3749  Fe-S-cluster domain-containing protein  45.16 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2404  hypothetical protein  36.36 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.594721  hitchhiker  0.0000312382 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1006  hypothetical protein  39.51 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3519  hypothetical protein  44.26 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2875  hypothetical protein  42.68 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2609  hypothetical protein  43.33 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0049  hypothetical protein  49.09 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1650  hypothetical protein  44.83 
 
 		 84 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0564934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2428  protein of unknown function UPF0153  43.4 
 
 		 84 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29830  hypothetical protein  41.94 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2476  hypothetical protein  43.59 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2450  protein YeiW  38.27 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0381641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2301  hypothetical protein  38.46 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.708032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2091  protein of unknown function UPF0153  41.67 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0939789  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4110  hypothetical protein  46.67 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0043  protein of unknown function UPF0153  44.26 
 
 		 88 aa  40.8  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0353  protein of unknown function UPF0153  43.55 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0115675  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0035  hypothetical protein  35.63 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80121  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0792  hypothetical protein  47.27 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4025  hypothetical protein  41.94 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0024  hypothetical protein  43.33 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.643879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0038  hypothetical protein  35.63 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.304383  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2988  hypothetical protein  44.26 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000376291  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3788  hypothetical protein  47.27 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000190416 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3703  hypothetical protein  37.21 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3747  protein of unknown function UPF0153  42.86 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3767  hypothetical protein  43.33 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3235  hypothetical protein  34.44 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204615 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4019  hypothetical protein  48.15 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.561383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4475  hypothetical protein  42.62 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000150782  decreased coverage  0.00000000228641 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0575  hypothetical protein  41.94 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000579653  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0055  hypothetical protein  38.37 
 
 		 83 aa  40  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0585048  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>