50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0636 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0636  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  157  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207413  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2777  hypothetical protein  73.33 
 
 		 78 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0388254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2457  hypothetical protein  73.33 
 
 		 75 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0579  protein of unknown function UPF0153  62.67 
 
 		 76 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000485137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0592  protein of unknown function UPF0153  62.67 
 
 		 76 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00030944 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0219  protein of unknown function UPF0153  52.63 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0119  hypothetical protein  51.52 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.226036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3519  hypothetical protein  48.28 
 
 		 84 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4195  hypothetical protein  48.28 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0876839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3912  hypothetical protein  49.06 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1658  hypothetical protein  48.28 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2510  hypothetical protein  49.09 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0872529  normal  0.87408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3767  hypothetical protein  46.55 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0608  protein of unknown function UPF0153  45 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00802731  normal  0.548911 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3252  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0649  protein of unknown function UPF0153  45 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572845  normal  0.0906583 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4025  hypothetical protein  46.55 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90654  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1510  hypothetical protein  46.55 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3121  proteinase inhibitor  46.55 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2359  protein YeiW  39.29 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000642497  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0356  hypothetical protein  45.31 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0447585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44090  putative Fe-S-cluster oxidoreductase  46.55 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2609  hypothetical protein  44.83 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3094  hypothetical protein  46.55 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2040  hypothetical protein  46.55 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.321846  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2192  hypothetical protein  44.26 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.583182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2091  protein of unknown function UPF0153  40.98 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0939789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0740  hypothetical protein  46.55 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2573  hypothetical protein  46.55 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2170  hypothetical protein  46.55 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.298759  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3059  hypothetical protein  46.55 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3749  Fe-S-cluster domain-containing protein  44.83 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4110  hypothetical protein  43.1 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0575  hypothetical protein  44.83 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000579653  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1006  hypothetical protein  34.57 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2450  protein YeiW  39.02 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0381641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0755  hypothetical protein  43.1 
 
 		 95 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4222  hypothetical protein  40.98 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2875  hypothetical protein  44.83 
 
 		 88 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2404  hypothetical protein  36.9 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.594721  hitchhiker  0.0000312382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3673  protein of unknown function UPF0153  42.19 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0603  hypothetical protein  42.11 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0856  hypothetical protein  44.83 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3121  protein of unknown function UPF0153  44.83 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2002  hypothetical protein  42.62 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.786219  normal  0.232569 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1650  hypothetical protein  44.07 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0564934  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3788  hypothetical protein  43.75 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000190416 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0792  hypothetical protein  44.83 
 
 		 105 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3747  protein of unknown function UPF0153  42.37 
 
 		 86 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2428  protein of unknown function UPF0153  43.4 
 
 		 84 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>