More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0149 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3448  acetate kinase  88.09 
 
 
403 aa  735    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0149  acetate kinase  100 
 
 
404 aa  824    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  57.21 
 
 
421 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  56.22 
 
 
421 aa  497  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  56.22 
 
 
421 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  58.21 
 
 
421 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  58.21 
 
 
421 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0394  acetate kinase  57.86 
 
 
419 aa  485  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  55.36 
 
 
421 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  55.22 
 
 
421 aa  474  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  54.23 
 
 
420 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  53.88 
 
 
417 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0328  acetate kinase  54.39 
 
 
409 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000406693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  50.63 
 
 
421 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0348  acetate kinase  54.14 
 
 
409 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0720  acetate kinase  43.61 
 
 
452 aa  366  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0988409  hitchhiker  0.0000000373865 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  43.86 
 
 
398 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  43.47 
 
 
397 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  45.02 
 
 
399 aa  358  8e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  45 
 
 
405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  42.89 
 
 
399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  43.86 
 
 
398 aa  354  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  42.36 
 
 
397 aa  352  7e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  41.85 
 
 
397 aa  349  4e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  43.22 
 
 
398 aa  345  7e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  41.63 
 
 
404 aa  341  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  42.57 
 
 
403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  42.57 
 
 
403 aa  340  4e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  41.96 
 
 
397 aa  339  5e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  45.27 
 
 
401 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  42.36 
 
 
408 aa  335  9e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  42.09 
 
 
399 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  41.92 
 
 
397 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  42.79 
 
 
401 aa  334  1e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  42 
 
 
398 aa  334  2e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  41.46 
 
 
397 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  41.46 
 
 
397 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  41.46 
 
 
397 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  41.46 
 
 
397 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  41.46 
 
 
397 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  41.46 
 
 
397 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  41.41 
 
 
397 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  41.16 
 
 
397 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  41.41 
 
 
397 aa  333  5e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  42.71 
 
 
397 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  40.1 
 
 
397 aa  331  1e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  43.47 
 
 
396 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  41.54 
 
 
406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  39.6 
 
 
398 aa  324  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  41.35 
 
 
396 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  42.75 
 
 
397 aa  323  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  41.35 
 
 
395 aa  322  8e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  41.73 
 
 
402 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  41.12 
 
 
406 aa  318  7.999999999999999e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  42.86 
 
 
400 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  42.89 
 
 
399 aa  316  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  39.6 
 
 
398 aa  316  6e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  38.75 
 
 
399 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  39.85 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  37 
 
 
398 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  37 
 
 
398 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  42.39 
 
 
399 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  40.05 
 
 
404 aa  312  6.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  38.94 
 
 
397 aa  312  6.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  41.87 
 
 
401 aa  311  9e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  42.86 
 
 
398 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  44 
 
 
380 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  42.14 
 
 
399 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  42.14 
 
 
399 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  42.01 
 
 
402 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  42.72 
 
 
398 aa  308  8e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  41.6 
 
 
399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  41.6 
 
 
399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  41.6 
 
 
399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  41.6 
 
 
399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  41.21 
 
 
413 aa  306  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  40.84 
 
 
399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  39.05 
 
 
394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25160  acetate kinase  40.9 
 
 
403 aa  304  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.748189  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  40.6 
 
 
399 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  40.74 
 
 
404 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  39.11 
 
 
402 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  39.95 
 
 
396 aa  302  8.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  39.24 
 
 
417 aa  301  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  40 
 
 
397 aa  301  1e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  41.25 
 
 
398 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  39.25 
 
 
414 aa  298  1e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  41.58 
 
 
398 aa  298  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3600  propionate/acetate kinase  40.6 
 
 
402 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  39.05 
 
 
397 aa  295  9e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  39.65 
 
 
404 aa  294  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3504  propionate/acetate kinase  40.6 
 
 
402 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  37.68 
 
 
406 aa  294  2e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3537  propionate/acetate kinase  40.6 
 
 
402 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.831906  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3433  propionate/acetate kinase  40.6 
 
 
402 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3430  propionate/acetate kinase  40.6 
 
 
402 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  39.95 
 
 
400 aa  293  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  38.72 
 
 
396 aa  292  9e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2921  acetate kinase  38.85 
 
 
772 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.602994 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  38.21 
 
 
396 aa  291  2e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>