More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0348 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0328  acetate kinase  96.33 
 
 		 409 aa  815    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000406693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0348  acetate kinase  100 
 
 		 409 aa  843    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0394  acetate kinase  65.41 
 
 		 419 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  58.15 
 
 		 421 aa  501  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  58.65 
 
 		 421 aa  504  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  56.5 
 
 		 421 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  56.39 
 
 		 421 aa  497  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  56.64 
 
 		 421 aa  494  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  55.39 
 
 		 421 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  55.5 
 
 		 421 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  56.89 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  54.16 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3448  acetate kinase  55.39 
 
 		 403 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  53.38 
 
 		 421 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0149  acetate kinase  54.14 
 
 		 404 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0720  acetate kinase  47.37 
 
 		 452 aa  392  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0988409  hitchhiker  0.0000000373865 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  48.12 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  45.5 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  47.56 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  48.4 
 
 		 402 aa  378  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  45.5 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  44.75 
 
 		 405 aa  368  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  46.5 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  46.5 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  46.02 
 
 		 406 aa  364  1e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  45.02 
 
 		 406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  44.86 
 
 		 399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  45.86 
 
 		 397 aa  355  1e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  43.61 
 
 		 408 aa  351  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  42.75 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  43.36 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  43.61 
 
 		 398 aa  352  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  43.73 
 
 		 396 aa  348  8e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  43.11 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  43 
 
 		 404 aa  347  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  45.79 
 
 		 404 aa  347  2e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  43.86 
 
 		 397 aa  346  3e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  44.27 
 
 		 397 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  44.11 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  46.06 
 
 		 402 aa  346  4e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  44.92 
 
 		 401 aa  345  8.999999999999999e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  44.02 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  45.5 
 
 		 401 aa  344  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  44.27 
 
 		 402 aa  343  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  45.5 
 
 		 397 aa  343  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  43.77 
 
 		 397 aa  342  5e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  43.77 
 
 		 397 aa  342  5e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  43.77 
 
 		 397 aa  342  5e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  44.91 
 
 		 404 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  43.77 
 
 		 397 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  43.77 
 
 		 397 aa  342  7e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  43.77 
 
 		 397 aa  342  7e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  43.51 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  41.43 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  43.26 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  43.51 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  44.78 
 
 		 396 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  42.89 
 
 		 417 aa  340  4e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  42.5 
 
 		 398 aa  339  5e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  41.88 
 
 		 397 aa  339  5e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  45.21 
 
 		 401 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  42.86 
 
 		 401 aa  338  9.999999999999999e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  44.42 
 
 		 398 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  42.11 
 
 		 395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  43.77 
 
 		 397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  43.36 
 
 		 399 aa  335  9e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  44.11 
 
 		 400 aa  333  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  44.11 
 
 		 400 aa  333  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  45.86 
 
 		 399 aa  333  5e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  44.36 
 
 		 414 aa  330  3e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  43.19 
 
 		 398 aa  324  2e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  44.33 
 
 		 398 aa  323  4e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  41.75 
 
 		 396 aa  322  8e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  42.11 
 
 		 414 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  42.39 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  42.39 
 
 		 399 aa  320  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  42.54 
 
 		 396 aa  319  6e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  44.5 
 
 		 398 aa  319  7e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  42.13 
 
 		 399 aa  318  9e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  42.13 
 
 		 399 aa  318  9e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002968  acetate kinase  43.14 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  42.13 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  41.92 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  42.04 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  39.49 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0641  acetate kinase  38.29 
 
 		 405 aa  317  3e-85  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00773095  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  43.61 
 
 		 398 aa  317  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02942  acetate kinase  44.14 
 
 		 398 aa  317  3e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  39.6 
 
 		 399 aa  315  8e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  41.37 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  41.37 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  41.37 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  41.37 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2295  acetate kinase  41.5 
 
 		 395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  43.22 
 
 		 380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  43.51 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  40.35 
 
 		 397 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  42.86 
 
 		 398 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  41.52 
 
 		 398 aa  312  5.999999999999999e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2112  acetate kinase  42.64 
 
 		 398 aa  312  6.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0121493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>