17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3300 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3300  flagellar export protein FliJ  100 
 
 
147 aa  275  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3430  flagellar export protein FliJ  52.78 
 
 
148 aa  140  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0414  flagellar protein FliJ, putative  45.45 
 
 
146 aa  114  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3108  flagellar export FliJ  45.99 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4209  flagellar export protein FliJ  40.97 
 
 
148 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3834  flagellar export protein FliJ  43.06 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3918  flagellar export protein FliJ  43.06 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0469  flagellar export protein FliJ  29.08 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.554161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2047  flagellar export protein FliJ  29.41 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2071  flagellar export protein FliJ  32.39 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1395  flagellar export protein FliJ  30 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1393  flagellar export protein FliJ  30.37 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2705  putative flagellar FliJ protein  30.28 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.49892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1689  flagellar export protein FliJ  27.61 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2249  flagellar export protein FliJ  29.25 
 
 
147 aa  40.8  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634944  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1219  flagellar protein FliJ, putative  25.87 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2404  flagellar export protein FliJ  32.88 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>