11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3430 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3430  flagellar export protein FliJ  100 
 
 
148 aa  288  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3300  flagellar export protein FliJ  52.78 
 
 
147 aa  140  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0414  flagellar protein FliJ, putative  45.99 
 
 
146 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3108  flagellar export FliJ  43.8 
 
 
148 aa  110  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4209  flagellar export protein FliJ  44.6 
 
 
148 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3834  flagellar export protein FliJ  42.66 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3918  flagellar export protein FliJ  42.66 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1395  flagellar export protein FliJ  29.2 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2047  flagellar export protein FliJ  27.82 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0469  flagellar export protein FliJ  26.81 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.554161  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2705  putative flagellar FliJ protein  30.14 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.49892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>