13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0414 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0414  flagellar protein FliJ, putative  100 
 
 
146 aa  290  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3108  flagellar export FliJ  71.72 
 
 
148 aa  209  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4209  flagellar export protein FliJ  50 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3430  flagellar export protein FliJ  45.99 
 
 
148 aa  114  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3300  flagellar export protein FliJ  45.45 
 
 
147 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3834  flagellar export protein FliJ  47.45 
 
 
145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3918  flagellar export protein FliJ  47.45 
 
 
145 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0469  flagellar export protein FliJ  25.71 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.554161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2047  flagellar export protein FliJ  25.55 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2705  putative flagellar FliJ protein  28.1 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.49892  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1393  flagellar export protein FliJ  32.48 
 
 
146 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2169  flagellar export protein FliJ  23.94 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1395  flagellar export protein FliJ  28.08 
 
 
146 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>