12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3108 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3108  flagellar export FliJ  100 
 
 		 148 aa  292  9e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0414  flagellar protein FliJ, putative  71.72 
 
 		 146 aa  209  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4209  flagellar export protein FliJ  53.24 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3300  flagellar export protein FliJ  45.99 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3430  flagellar export protein FliJ  43.8 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3834  flagellar export protein FliJ  45 
 
 		 145 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3918  flagellar export protein FliJ  45 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2705  putative flagellar FliJ protein  28.7 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.49892  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0698  flagellar export protein FliJ  34.21 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.234685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0469  flagellar export protein FliJ  23.88 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.554161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2047  flagellar export protein FliJ  25.37 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1393  flagellar export protein FliJ  31.62 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>