58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1345 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1345  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  614  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.389026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3383  hypothetical protein  52.21 
 
 		 309 aa  255  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0874334 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1609  putative secreted peptidyl prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  43.75 
 
 		 336 aa  242  7e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.308784  normal  0.220837 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01865  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.18 
 
 		 328 aa  235  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.177579  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1243  putative secreted peptidyl prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  44.49 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.768744  normal  0.0956749 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1448  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.4 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6103  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.4 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1826  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  41.02 
 
 		 316 aa  149  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.068231  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4968  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  30.33 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02584  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  33.99 
 
 		 265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000223944  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1552  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  29.27 
 
 		 243 aa  93.6  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0710319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2186  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  30 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2187  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  28.47 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1871  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  29.14 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0364258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1085  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  29.89 
 
 		 168 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1098  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  30.64 
 
 		 169 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0363863 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2154  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.21 
 
 		 174 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4043  peptidylprolyl isomerase  30.29 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1153  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  30.29 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1917  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  30.86 
 
 		 169 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1917  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  29.65 
 
 		 167 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0670  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  28.38 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.454239  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2192  peptidylprolyl isomerase  26.01 
 
 		 238 aa  53.9  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1750  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  26.44 
 
 		 169 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145251  normal  0.12658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1936  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  27.33 
 
 		 169 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0726086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0740  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  26.7 
 
 		 170 aa  52.8  0.000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0740417  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2347  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  25.58 
 
 		 189 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1870  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  26.01 
 
 		 150 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.011662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1093  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  27.91 
 
 		 168 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1054  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  27.91 
 
 		 168 aa  50.8  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1250  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  27.17 
 
 		 177 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3531  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  26.74 
 
 		 155 aa  49.7  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  0.304144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1266  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  26.16 
 
 		 169 aa  49.3  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208727  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2251  peptidylprolyl isomerase  24.86 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629999  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2178  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  26.74 
 
 		 168 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2874  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  23.73 
 
 		 155 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.975821  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1935  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  26.29 
 
 		 190 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0913226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1749  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  26.29 
 
 		 190 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257519  normal  0.190555 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2111  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  25.56 
 
 		 190 aa  45.8  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1404  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  25 
 
 		 158 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0511  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  27.88 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3052  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  25 
 
 		 157 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2337  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  24.84 
 
 		 151 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0542  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  35.71 
 
 		 161 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000951207  normal  0.0890516 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0966  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  25.43 
 
 		 151 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0581  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  27.67 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1990  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  26.63 
 
 		 223 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.445693  normal  0.238348 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2448  peptidyl prolyl cis-trans isomerase  26.09 
 
 		 157 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3789  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  26.01 
 
 		 152 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.557514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0068  peptidylprolyl isomerase  21.21 
 
 		 203 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160965  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5486  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  26 
 
 		 196 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  23.27 
 
 		 151 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1056  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  28.81 
 
 		 260 aa  42.7  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0857508  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4367  peptidyl prolyl cis-trans isomerase (rotamase B)  23.78 
 
 		 154 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1148  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  25.44 
 
 		 148 aa  42.7  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.826874  normal  0.739185 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0739  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B  24.71 
 
 		 191 aa  42.7  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0427423  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2601  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  23.7 
 
 		 155 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0478945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2701  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.35 
 
 		 187 aa  42.7  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>