15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_R0047 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_R0047  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356766  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14023  tRNA-Val  94 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0030  tRNA-Val  90.91 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0027  tRNA-Val  90.91 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0027  tRNA-Val  90.91 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0034  tRNA-Val  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0031  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03370  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0012  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592098  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0011  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15450  tRNA-Val  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0490498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0035  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55919  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0581  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.162856  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0055  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>