More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2810 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2810  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 108 aa  218  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.978758  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4664  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 108 aa  218  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2616  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 108 aa  218  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4702  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 108 aa  218  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.677294  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3613  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 108 aa  218  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3431  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 108 aa  218  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4733  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 108 aa  218  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2168  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 108 aa  218  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226966  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3300  transposase IS3/IS911 family protein  56.48 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2896  transposase IS3/IS911 family protein  56.48 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2447  transposase IS3/IS911 family protein  55.86 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000211632  hitchhiker  0.00944163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1223  transposase IS3/IS911 family protein  56.76 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1221  transposase IS3/IS911 family protein  56.76 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.774632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3708  transposase IS3/IS911 family protein  50.51 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0112916  normal  0.204081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2520  transposase IS3/IS911 family protein  50.51 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000790886  hitchhiker  0.00717197 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25110  Transposase  48.62 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  47.71 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  47.75 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  47.75 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1217  transposase IS3/IS911 family protein  49.06 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  46.67 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  47.27 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20920  Transposase  44.66 
 
 		 104 aa  76.6  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2586  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  46.08 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  46.08 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  47.62 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  47.62 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  45.79 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  45.79 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  45.79 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  45.79 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  45.79 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1500  transposase IS3/IS911 family protein  45.79 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5123  transposase IS3/IS911  46.67 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5203  transposase IS3/IS911  46.67 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10853  transposase  46.3 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.71857e-46  hitchhiker  0.0000000080045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13358  transposase  46.3 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.49743e-39  normal  0.534479 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  44.66 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13131  transposase  46.3 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000102607  normal  0.123533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12829  transposase  46.3 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.40646e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13207  transposase  46.3 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.838360000000001e-28  normal  0.797381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2529  transposase IS3/IS911 family protein  48.04 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000311757  hitchhiker  0.00296744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11784  transposase  46.3 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.00725e-90  hitchhiker  0.0000000133913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11781  transposase  46.3 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.66965e-85  hitchhiker  0.000000000569119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12417  transposase  46.3 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.85202e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12380  transposase  46.3 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.5215000000000001e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3482  transposase IS3/IS911 family protein  48.04 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265992  hitchhiker  0.00308131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3607  transposase IS3/IS911 family protein  48.04 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00876611  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11740  transposase  46.3 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.53193e-56  normal  0.308652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11347  transposase  46.3 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.3772600000000003e-34  normal  0.888349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12113  transposase  46.3 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.72555e-57  normal  0.924844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12049  transposase  46.3 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.40799e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11807  transposase  46.3 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.601339999999999e-45  hitchhiker  0.00672447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12377  transposase  46.3 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.02474e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11791  transposase  46.3 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.324620000000001e-61  hitchhiker  0.00000385538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  44.66 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11774  transposase  46.3 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.9098299999999996e-43  hitchhiker  0.00000000075724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1596  transposase IS3 family protein  43.56 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1635  transposase IS3 family protein  43.56 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169974  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2514  transposase IS3 family protein  43.56 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1752  transposase IS3 family protein  43.56 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2976  Tn4652, transposase subunit A  46.79 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57447  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  43.56 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4440  transposase IS3/IS911 family protein  43.93 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5556  transposase IS3/IS911 family protein  43.93 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5065  transposase IS3/IS911 family protein  43.93 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5345  transposase IS3/IS911 family protein  43.93 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718951 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  44.55 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4729  transposase IS3/IS911 family protein  41.07 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  46.08 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  42.57 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4706  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  42.72 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  42.72 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  42.72 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2657  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2668  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0365  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1740  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.698666  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1178  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1174  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4659  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2800  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0137371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0713  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0818  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0366  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2587  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771833  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17790  Transposase  42.86 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.837137  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  42.57 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  42.57 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  40.78 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  40.78 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1796  transposase IS3/IS911 family protein  40.38 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4211  transposase IS3/IS911  42.99 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2097  hypothetical protein  38.1 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230614  normal  0.747224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>