More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3300 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3300  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
109 aa  220  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2896  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
109 aa  220  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1221  transposase IS3/IS911 family protein  53.27 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.774632  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1223  transposase IS3/IS911 family protein  53.27 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16285  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2447  transposase IS3/IS911 family protein  52.34 
 
 
108 aa  111  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000211632  hitchhiker  0.00944163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3431  transposase IS3/IS911 family protein  56.48 
 
 
108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4702  transposase IS3/IS911 family protein  56.48 
 
 
108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.677294  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3613  transposase IS3/IS911 family protein  56.48 
 
 
108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4664  transposase IS3/IS911 family protein  56.48 
 
 
108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2616  transposase IS3/IS911 family protein  56.48 
 
 
108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2168  transposase IS3/IS911 family protein  56.48 
 
 
108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226966  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2810  transposase IS3/IS911 family protein  56.48 
 
 
108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.978758  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4733  transposase IS3/IS911 family protein  56.48 
 
 
108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2520  transposase IS3/IS911 family protein  47.47 
 
 
110 aa  94  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000790886  hitchhiker  0.00717197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3708  transposase IS3/IS911 family protein  47.47 
 
 
110 aa  94  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0112916  normal  0.204081 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25110  Transposase  46.23 
 
 
106 aa  89.4  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  45.71 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  45.71 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3482  transposase IS3/IS911 family protein  45.37 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265992  hitchhiker  0.00308131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3607  transposase IS3/IS911 family protein  45.37 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00876611  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2529  transposase IS3/IS911 family protein  45.37 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000311757  hitchhiker  0.00296744 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1217  transposase IS3/IS911 family protein  44.76 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20920  Transposase  42.16 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0365  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4729  transposase IS3/IS911 family protein  39.05 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2657  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0713  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1174  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0818  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1178  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1740  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.698666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4659  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2587  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771833  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2800  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0137371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0366  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2668  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11781  transposase  44.12 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.66965e-85  hitchhiker  0.000000000569119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  42.16 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12377  transposase  44.12 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.02474e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11791  transposase  44.12 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.324620000000001e-61  hitchhiker  0.00000385538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11784  transposase  44.12 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.00725e-90  hitchhiker  0.0000000133913 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  42.16 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17790  Transposase  45.63 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.837137  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11807  transposase  44.12 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.601339999999999e-45  hitchhiker  0.00672447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13131  transposase  44.12 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000102607  normal  0.123533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13207  transposase  44.12 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.838360000000001e-28  normal  0.797381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13358  transposase  44.12 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.49743e-39  normal  0.534479 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12417  transposase  44.12 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.85202e-36  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12380  transposase  44.12 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.5215000000000001e-31  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12113  transposase  44.12 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.72555e-57  normal  0.924844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12049  transposase  44.12 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.40799e-27  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12829  transposase  44.12 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.40646e-19  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10853  transposase  44.12 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.71857e-46  hitchhiker  0.0000000080045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11347  transposase  44.12 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.3772600000000003e-34  normal  0.888349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11740  transposase  44.12 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.53193e-56  normal  0.308652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11774  transposase  44.12 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.9098299999999996e-43  hitchhiker  0.00000000075724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  43.12 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  40.19 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0063  transposase IS3/IS911 family protein  41.12 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5432  transposase IS3/IS911  43.81 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.115544 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5601  transposase IS3/IS911  43.81 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5829  transposase IS3/IS911 family protein  43.81 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.342164 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6002  transposase IS3/IS911 family protein  43.81 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000711123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
107 aa  67  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1500  transposase IS3/IS911 family protein  39.05 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1239  transposase IS3/IS911 family protein  40.2 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4440  transposase IS3/IS911 family protein  39.42 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5345  transposase IS3/IS911 family protein  39.42 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0718951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5556  transposase IS3/IS911 family protein  39.42 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5065  transposase IS3/IS911 family protein  39.42 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2223  transposase IS3/IS911 family protein  51.85 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.055564  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2586  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  38 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  38 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1203  transposase IS3/IS911 family protein  41.58 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  40.19 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  37.38 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  39.25 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  37.74 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  37.74 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  37.74 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0739  transposase IS3/IS911 family protein  37.37 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  37 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2045  transposase IS3/IS911 family protein  49.35 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00952003  normal  0.01022 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5654  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238743  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5988  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000845611 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0053  IS629, transposase orfA  36.79 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2788  IS629, transposase orfA  35.85 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.253032  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1169  IS629, transposase orfA  35.85 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.481035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2285  IS629, transposase orfA  35.85 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  hitchhiker  0.00000000000000192514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3873  IS629, transposase orfA  35.85 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.997702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3385  IS629, transposase orfA  35.85 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3515  IS629, transposase orfA  35.85 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0406871 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0042  IS629, transposase orfA  35.85 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0292  IS629, transposase orfA  35.85 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.642874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2844  IS629, transposase orfA  35.85 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.865071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4590  IS629, transposase orfA  35.85 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5443  transposase IS3/IS911 family protein  43.81 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181407  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>