14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0208 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0208  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  531  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0010863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0244  hypothetical protein  67.62 
 
 		 254 aa  338  8e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000208552  hitchhiker  0.000000653556 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0957  hypothetical protein  41.85 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614175 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3291  hypothetical protein  40.09 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000286826  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0403  hypothetical protein  26.23 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0819  hypothetical protein  26.87 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0952597  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0684  hypothetical protein  35.14 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0665668  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3076  hypothetical protein  30 
 
 		 440 aa  49.3  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616647  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0583  hypothetical protein  27.03 
 
 		 450 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2646  hypothetical protein  28.02 
 
 		 462 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0879  hypothetical protein  30.77 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00133282  hitchhiker  0.00000451683 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2158  hypothetical protein  22.71 
 
 		 377 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0096  hypothetical protein  24.05 
 
 		 368 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0153  peptidase S49  25.3 
 
 		 612 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.908032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>