36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3942 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3942  Apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  100 
 
 		 164 aa  328  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3857  Apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  92.07 
 
 		 164 aa  300  7.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1083  apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  44.44 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3167  Holo-ACP synthase  32.93 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2406  Holo-citrate lyase synthase  35.03 
 
 		 183 aa  70.5  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1166  apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  30.71 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.632968  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0636  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  29.49 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.298374  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04700  Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  29.08 
 
 		 467 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3011  holo-ACP synthase CitX  29.49 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140351  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0702  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  29.49 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00582  2'-(5'-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  29.49 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00571  hypothetical protein  29.49 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0528  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  29.49 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0633  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  29.49 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3030  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  29.49 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0665  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  29.49 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0424  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase (holo-ACP synthetase)  30.07 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0807  apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase, putative  33.59 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0327  apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  28.91 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0733  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  29.8 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0720  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  30 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0674  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  29.8 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0779  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  30 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0660  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  30 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0069  holo-ACP synthase CitX  41.86 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3371  Holo-ACP synthase  34.88 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0066  holo-ACP synthase CitX  40.7 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1671  Phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase (holo- ACP synthetase)-like protein  31.58 
 
 		 251 aa  53.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.420217  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0067  holo-ACP synthase CitX  40.7 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.449412 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0068  holo-ACP synthase CitX  40.7 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.063383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0067  holo-ACP synthase CitX  40.7 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2318  holo-ACP synthase CitX  26.67 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1756  holo-ACP synthase CitX  30.25 
 
 		 176 aa  51.2  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2216  holo-ACP synthase CitX  28.48 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2029  holo-ACP synthase CitX  37.18 
 
 		 175 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1523  citXG protein, putative  28.85 
 
 		 471 aa  45.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>