36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0067 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0067  holo-ACP synthase CitX  100 
 
 		 177 aa  362  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.449412 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0068  holo-ACP synthase CitX  98.87 
 
 		 183 aa  359  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.063383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0067  holo-ACP synthase CitX  98.87 
 
 		 183 aa  359  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0066  holo-ACP synthase CitX  98.31 
 
 		 183 aa  357  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0069  holo-ACP synthase CitX  98.31 
 
 		 183 aa  356  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0779  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  46.2 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0660  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  45.57 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0733  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  46.79 
 
 		 183 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0674  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  47.44 
 
 		 183 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0720  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  45.57 
 
 		 183 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0636  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  44.38 
 
 		 183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.298374  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3011  holo-ACP synthase CitX  44.38 
 
 		 183 aa  137  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140351  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00571  hypothetical protein  44.38 
 
 		 183 aa  137  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0702  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  44.38 
 
 		 183 aa  137  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0528  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  44.38 
 
 		 183 aa  137  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00582  2'-(5'-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  44.38 
 
 		 183 aa  137  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0633  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  44.38 
 
 		 183 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3030  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  43.75 
 
 		 183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0665  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  43.75 
 
 		 183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2029  holo-ACP synthase CitX  37.43 
 
 		 175 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1756  holo-ACP synthase CitX  37.43 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3371  Holo-ACP synthase  40.59 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0327  apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  38.12 
 
 		 178 aa  114  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2406  Holo-citrate lyase synthase  38.46 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2318  holo-ACP synthase CitX  40.62 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2216  holo-ACP synthase CitX  40.12 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3167  Holo-ACP synthase  40.37 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1166  apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  32.35 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.632968  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0424  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase (holo-ACP synthetase)  30.34 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1523  citXG protein, putative  26.38 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04700  Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  25.17 
 
 		 467 aa  59.3  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1083  apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  29.92 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3942  Apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  40.7 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3857  Apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  28.93 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0807  apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase, putative  41.94 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1671  Phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase (holo- ACP synthetase)-like protein  30.13 
 
 		 251 aa  45.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.420217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>