36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0633 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3011  holo-ACP synthase CitX  99.45 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140351  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00582  2'-(5'-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  99.45 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00571  hypothetical protein  99.45 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0702  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  99.45 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0528  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  99.45 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0633  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0665  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  98.91 
 
 		 183 aa  367  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0636  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  98.91 
 
 		 183 aa  368  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.298374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3030  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  98.91 
 
 		 183 aa  367  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0660  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  75.42 
 
 		 183 aa  270  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0720  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  74.86 
 
 		 183 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0779  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  74.86 
 
 		 183 aa  268  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0674  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  73.48 
 
 		 183 aa  267  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0733  2'-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephospho-CoA:apo- citrate lyase  74.3 
 
 		 183 aa  265  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3167  Holo-ACP synthase  50.58 
 
 		 182 aa  175  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0327  apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  42.61 
 
 		 178 aa  144  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2029  holo-ACP synthase CitX  40.24 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0066  holo-ACP synthase CitX  43.9 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0067  holo-ACP synthase CitX  43.9 
 
 		 183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0068  holo-ACP synthase CitX  43.9 
 
 		 183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.063383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1756  holo-ACP synthase CitX  40.85 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0067  holo-ACP synthase CitX  44.38 
 
 		 177 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.449412 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0069  holo-ACP synthase CitX  43.29 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2216  holo-ACP synthase CitX  42.07 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2406  Holo-citrate lyase synthase  41.32 
 
 		 183 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2318  holo-ACP synthase CitX  40.85 
 
 		 180 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3371  Holo-ACP synthase  35.76 
 
 		 179 aa  117  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0424  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase (holo-ACP synthetase)  29.82 
 
 		 183 aa  90.9  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1166  apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  30.97 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.632968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04700  Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  28.83 
 
 		 467 aa  81.6  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3942  Apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  29.49 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3857  Apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  28.48 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1523  citXG protein, putative  29.75 
 
 		 471 aa  62  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1083  apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  28.66 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1671  Phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase (holo- ACP synthetase)-like protein  31.53 
 
 		 251 aa  46.6  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.420217  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0807  apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase, putative  36.49 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>