25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2832 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2832  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2139  hypothetical protein  53.7 
 
 
260 aa  265  8e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  38.86 
 
 
455 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2762  uncharacterized MobA-related protein-like protein  33.63 
 
 
251 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4166  hypothetical protein  39.23 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0816  conserved hypothetical protein  39.23 
 
 
256 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0832  hypothetical protein  39.23 
 
 
256 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.828013  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3201  hypothetical protein  38.76 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3009  hypothetical protein  38.76 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3036  hypothetical protein  38.76 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02709  hypothetical protein  38.76 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02671  hypothetical protein  38.76 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3933  anaerobic dehydrogenase cluster protein  37.33 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.239869  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0359  hypothetical protein  30.96 
 
 
233 aa  106  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000392  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1685  hypothetical protein  29.39 
 
 
243 aa  97.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0034  hypothetical protein  32.48 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2112  anaerobic dehydrogenase cluster protein  31.38 
 
 
279 aa  95.5  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0179  uncharacterized MobA-related protein-like protein  30.7 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1463  anaerobic dehydrogenase cluster protein  31.58 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1491  hypothetical protein  34.81 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2206  hypothetical protein  30.69 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0247  hypothetical protein  29.25 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.333504 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1305  anaerobic dehydrogenase cluster protein  27.98 
 
 
254 aa  58.9  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355701  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0835  hypothetical protein  26.4 
 
 
256 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  27.42 
 
 
394 aa  54.7  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>