17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0835 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0835  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225401  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1305  anaerobic dehydrogenase cluster protein  33.73 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355701  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3933  anaerobic dehydrogenase cluster protein  31.25 
 
 
253 aa  92.4  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.239869  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1463  anaerobic dehydrogenase cluster protein  32.95 
 
 
263 aa  87  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2112  anaerobic dehydrogenase cluster protein  29.52 
 
 
279 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2762  uncharacterized MobA-related protein-like protein  27.38 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2139  hypothetical protein  27.39 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0034  hypothetical protein  33.94 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2832  hypothetical protein  26.4 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0247  hypothetical protein  27.04 
 
 
234 aa  52.4  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.333504 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3036  hypothetical protein  26.71 
 
 
256 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02709  hypothetical protein  26.71 
 
 
256 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02671  hypothetical protein  26.71 
 
 
256 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0832  hypothetical protein  26.03 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.828013  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3009  hypothetical protein  26.03 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0816  conserved hypothetical protein  26.03 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3201  hypothetical protein  26.03 
 
 
235 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>