25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0247 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0247  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  477  1e-134  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.333504 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1685  hypothetical protein  33.18 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1491  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0179  uncharacterized MobA-related protein-like protein  30.3 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0359  hypothetical protein  29.44 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000392  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0034  hypothetical protein  31.21 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2762  uncharacterized MobA-related protein-like protein  28.97 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3036  hypothetical protein  30.81 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02671  hypothetical protein  30.81 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02709  hypothetical protein  30.81 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2139  hypothetical protein  30.09 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0832  hypothetical protein  29.73 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.828013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2832  hypothetical protein  29.25 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0816  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4166  hypothetical protein  30.85 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3201  hypothetical protein  29.51 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3009  hypothetical protein  29.19 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  28.47 
 
 		 394 aa  65.5  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  32.05 
 
 		 455 aa  58.9  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2206  hypothetical protein  35.24 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3933  anaerobic dehydrogenase cluster protein  29.44 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.239869  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1305  anaerobic dehydrogenase cluster protein  23.41 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0835  hypothetical protein  27.04 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225401  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2112  anaerobic dehydrogenase cluster protein  24.57 
 
 		 279 aa  51.6  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1463  anaerobic dehydrogenase cluster protein  28.26 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>