25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2139 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2139  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2832  hypothetical protein  53.7 
 
 		 271 aa  265  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2762  uncharacterized MobA-related protein-like protein  33.92 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  37.56 
 
 		 455 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02671  hypothetical protein  33.47 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4166  hypothetical protein  33.47 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3036  hypothetical protein  33.47 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02709  hypothetical protein  33.47 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0816  conserved hypothetical protein  33.47 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0832  hypothetical protein  33.47 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.828013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3201  hypothetical protein  33.06 
 
 		 235 aa  122  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3009  hypothetical protein  33.06 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0034  hypothetical protein  36.19 
 
 		 272 aa  115  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3933  anaerobic dehydrogenase cluster protein  33.63 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.239869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1491  hypothetical protein  31.39 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0359  hypothetical protein  33.03 
 
 		 233 aa  94.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000392  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2112  anaerobic dehydrogenase cluster protein  29.96 
 
 		 279 aa  92  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1685  hypothetical protein  26.4 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0179  uncharacterized MobA-related protein-like protein  32.52 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0247  hypothetical protein  30.09 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.333504 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2206  hypothetical protein  31.09 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1463  anaerobic dehydrogenase cluster protein  29.58 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0835  hypothetical protein  27.39 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  27.19 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1305  anaerobic dehydrogenase cluster protein  26.92 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>