47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2126 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2126  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  322  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.141627 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2092  hypothetical protein  96.75 
 
 
154 aa  308  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000213437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1675  hypothetical protein  57.14 
 
 
156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000169568  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2966  hypothetical protein  41.35 
 
 
188 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00552421 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5081  hypothetical protein  33.55 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.52253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5779  hypothetical protein  33.55 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2808  hypothetical protein  38.24 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.042805  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4402  hypothetical protein  37.59 
 
 
149 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0177  hypothetical protein  32.03 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3847  hypothetical protein  29.73 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3928  hypothetical protein  29.73 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1524  hypothetical protein  43.48 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.307449 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0068  hypothetical protein  30.41 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3125  hypothetical protein  29.73 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0246  hypothetical protein  32.03 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1692  hypothetical protein  29.73 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3426  hypothetical protein  29.73 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.89324  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4276  hypothetical protein  41.35 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.511336 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2850  hypothetical protein  29.73 
 
 
177 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2843  hypothetical protein  32.03 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0264  hypothetical protein  32.03 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0721  hypothetical protein  36.09 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943165  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0173  hypothetical protein  33.9 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047506  normal  0.243494 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4399  hypothetical protein  38.24 
 
 
163 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3806  hypothetical protein  35.29 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3366  hypothetical protein  32.03 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0188548  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3174  hypothetical protein  30.41 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0190  hypothetical protein  30.47 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2579  hypothetical protein  43.01 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109298  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0958  hypothetical protein  33.05 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0536  hypothetical protein  38.32 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61454  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1747  hypothetical protein  31.85 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0192  hypothetical protein  31.85 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357968  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0974  hypothetical protein  31.85 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.187621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1526  hypothetical protein  31.85 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238585  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4088  hypothetical protein  39.78 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3679  hypothetical protein  30.51 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.243952 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1724  hypothetical protein  33.85 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1903  hypothetical protein  33.85 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1084  hypothetical protein  38.54 
 
 
107 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1363  hypothetical protein  34.35 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131173  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2248  hypothetical protein  35.51 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298446  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0127  hypothetical protein  39.78 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1442  hypothetical protein  31.94 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0490295  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2677  hypothetical protein  35.16 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0956  hypothetical protein  33.98 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3681  hypothetical protein  35.96 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.235304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>