47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4276 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4276  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.511336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3806  hypothetical protein  39.89 
 
 
181 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0536  hypothetical protein  43.84 
 
 
168 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61454  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2966  hypothetical protein  36.7 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00552421 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4088  hypothetical protein  50.96 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0068  hypothetical protein  45.83 
 
 
167 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2850  hypothetical protein  45.14 
 
 
177 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3125  hypothetical protein  45.14 
 
 
167 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1692  hypothetical protein  45.14 
 
 
167 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3426  hypothetical protein  45.14 
 
 
167 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.89324  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3366  hypothetical protein  42.26 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0188548  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3928  hypothetical protein  45.14 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3847  hypothetical protein  45.14 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0190  hypothetical protein  45.83 
 
 
151 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0177  hypothetical protein  45.83 
 
 
167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0127  hypothetical protein  40.11 
 
 
181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2843  hypothetical protein  40.48 
 
 
167 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0264  hypothetical protein  40.48 
 
 
167 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0246  hypothetical protein  40.48 
 
 
167 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0173  hypothetical protein  42.36 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047506  normal  0.243494 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4399  hypothetical protein  39.16 
 
 
163 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5779  hypothetical protein  38.46 
 
 
163 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5081  hypothetical protein  38.46 
 
 
170 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.52253  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3174  hypothetical protein  45.14 
 
 
167 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4402  hypothetical protein  40.97 
 
 
149 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2248  hypothetical protein  40.67 
 
 
151 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298446  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0958  hypothetical protein  36.36 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3679  hypothetical protein  34.34 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.243952 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2579  hypothetical protein  44.79 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109298  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0721  hypothetical protein  38.41 
 
 
149 aa  87.8  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943165  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2808  hypothetical protein  39.81 
 
 
163 aa  87.4  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.042805  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1903  hypothetical protein  38.84 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1675  hypothetical protein  35.85 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000169568  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1724  hypothetical protein  38.84 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0192  hypothetical protein  42.71 
 
 
163 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357968  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0974  hypothetical protein  42.71 
 
 
163 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.187621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1747  hypothetical protein  42.71 
 
 
163 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1526  hypothetical protein  42.71 
 
 
163 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238585  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1084  hypothetical protein  42.71 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2092  hypothetical protein  39.42 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000213437  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0956  hypothetical protein  35.42 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1524  hypothetical protein  43.43 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.307449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1442  hypothetical protein  42.45 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0490295  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2126  hypothetical protein  41.35 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.141627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2677  hypothetical protein  36.11 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3681  hypothetical protein  37.5 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1363  hypothetical protein  35.58 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131173  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>