47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0177 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0177  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  330  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3366  hypothetical protein  91.62 
 
 		 167 aa  310  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0188548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2843  hypothetical protein  90.42 
 
 		 167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0246  hypothetical protein  90.42 
 
 		 167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0264  hypothetical protein  90.42 
 
 		 167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0190  hypothetical protein  98.01 
 
 		 151 aa  292  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0173  hypothetical protein  85.03 
 
 		 167 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047506  normal  0.243494 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3125  hypothetical protein  60.48 
 
 		 167 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1692  hypothetical protein  60.48 
 
 		 167 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3426  hypothetical protein  60.48 
 
 		 167 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.89324  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0068  hypothetical protein  59.88 
 
 		 167 aa  195  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2850  hypothetical protein  60.84 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4399  hypothetical protein  67.13 
 
 		 163 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3928  hypothetical protein  59.88 
 
 		 167 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3847  hypothetical protein  59.88 
 
 		 167 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5081  hypothetical protein  67.13 
 
 		 170 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.52253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5779  hypothetical protein  67.13 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3806  hypothetical protein  60.26 
 
 		 181 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3174  hypothetical protein  59.88 
 
 		 167 aa  174  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0127  hypothetical protein  57.96 
 
 		 181 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2966  hypothetical protein  51.45 
 
 		 188 aa  147  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00552421 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0536  hypothetical protein  46.58 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4276  hypothetical protein  43.45 
 
 		 155 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.511336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4088  hypothetical protein  52.88 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0721  hypothetical protein  40.67 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943165  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4402  hypothetical protein  38.32 
 
 		 149 aa  101  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2808  hypothetical protein  43.93 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.042805  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0958  hypothetical protein  37.84 
 
 		 155 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1524  hypothetical protein  37.16 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.307449 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2248  hypothetical protein  41.56 
 
 		 151 aa  89  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3679  hypothetical protein  35.14 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.243952 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1675  hypothetical protein  37.23 
 
 		 156 aa  84  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0192  hypothetical protein  38.1 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357968  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0974  hypothetical protein  38.1 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.187621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1747  hypothetical protein  38.1 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1526  hypothetical protein  38.1 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2126  hypothetical protein  31.37 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.141627 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1363  hypothetical protein  34.75 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2092  hypothetical protein  30.72 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000213437  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1724  hypothetical protein  38.66 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1903  hypothetical protein  38.66 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0956  hypothetical protein  35.17 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1442  hypothetical protein  36.59 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0490295  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2677  hypothetical protein  37.75 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1084  hypothetical protein  42.55 
 
 		 107 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2579  hypothetical protein  39.45 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109298  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3681  hypothetical protein  36.89 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>