47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2248 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2248  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  300  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298446  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3679  hypothetical protein  50.32 
 
 
155 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.243952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0958  hypothetical protein  47.74 
 
 
155 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0956  hypothetical protein  49.67 
 
 
150 aa  134  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3681  hypothetical protein  65 
 
 
149 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4276  hypothetical protein  40.67 
 
 
155 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.511336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2843  hypothetical protein  43.14 
 
 
167 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0246  hypothetical protein  43.14 
 
 
167 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0264  hypothetical protein  43.14 
 
 
167 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3366  hypothetical protein  41.18 
 
 
167 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0188548  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0190  hypothetical protein  42.38 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0177  hypothetical protein  41.06 
 
 
167 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3806  hypothetical protein  37.79 
 
 
181 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3426  hypothetical protein  37.75 
 
 
167 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.89324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1692  hypothetical protein  37.75 
 
 
167 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3125  hypothetical protein  37.75 
 
 
167 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2850  hypothetical protein  37.75 
 
 
177 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0068  hypothetical protein  37.09 
 
 
167 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0173  hypothetical protein  38 
 
 
167 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047506  normal  0.243494 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4402  hypothetical protein  39.13 
 
 
149 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3928  hypothetical protein  37.09 
 
 
167 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3847  hypothetical protein  37.09 
 
 
167 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2966  hypothetical protein  40.38 
 
 
188 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00552421 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0721  hypothetical protein  39.13 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943165  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2808  hypothetical protein  42.98 
 
 
163 aa  85.1  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.042805  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0536  hypothetical protein  40.19 
 
 
168 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61454  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4088  hypothetical protein  40.38 
 
 
164 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0127  hypothetical protein  42.31 
 
 
181 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5779  hypothetical protein  35.03 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3174  hypothetical protein  37.86 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1675  hypothetical protein  37.42 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000169568  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4399  hypothetical protein  35.29 
 
 
163 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5081  hypothetical protein  34.39 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.52253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2092  hypothetical protein  32.14 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000213437  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0192  hypothetical protein  32.9 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357968  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0974  hypothetical protein  32.9 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.187621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1747  hypothetical protein  32.9 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1526  hypothetical protein  32.9 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2126  hypothetical protein  32.14 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.141627 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1724  hypothetical protein  33.83 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1903  hypothetical protein  33.83 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2579  hypothetical protein  38.78 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1084  hypothetical protein  37.76 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1363  hypothetical protein  35.92 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131173  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1442  hypothetical protein  30.41 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0490295  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1524  hypothetical protein  36.63 
 
 
159 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.307449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2677  hypothetical protein  35.11 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>