47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0190 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0190  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  297  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0177  hypothetical protein  98.01 
 
 
167 aa  292  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3366  hypothetical protein  92.72 
 
 
167 aa  283  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0188548  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0246  hypothetical protein  92.05 
 
 
167 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0264  hypothetical protein  92.05 
 
 
167 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2843  hypothetical protein  92.05 
 
 
167 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0173  hypothetical protein  86.67 
 
 
167 aa  261  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047506  normal  0.243494 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4399  hypothetical protein  67.13 
 
 
163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5779  hypothetical protein  67.13 
 
 
163 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2850  hypothetical protein  66.43 
 
 
177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5081  hypothetical protein  67.13 
 
 
170 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.52253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3125  hypothetical protein  66.43 
 
 
167 aa  193  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1692  hypothetical protein  66.43 
 
 
167 aa  193  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3426  hypothetical protein  66.43 
 
 
167 aa  193  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.89324  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0068  hypothetical protein  65.73 
 
 
167 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3847  hypothetical protein  65.73 
 
 
167 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3928  hypothetical protein  65.73 
 
 
167 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3806  hypothetical protein  60.9 
 
 
181 aa  178  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3174  hypothetical protein  65.73 
 
 
167 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0127  hypothetical protein  58.6 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2966  hypothetical protein  54.04 
 
 
188 aa  147  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00552421 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0536  hypothetical protein  47.26 
 
 
168 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61454  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4276  hypothetical protein  45.83 
 
 
155 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.511336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4088  hypothetical protein  53.85 
 
 
164 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0721  hypothetical protein  40.67 
 
 
149 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943165  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4402  hypothetical protein  40.41 
 
 
149 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2808  hypothetical protein  42.99 
 
 
163 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.042805  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0958  hypothetical protein  36.49 
 
 
155 aa  94  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1524  hypothetical protein  37.16 
 
 
159 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.307449 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2248  hypothetical protein  42.38 
 
 
151 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298446  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0192  hypothetical protein  38.1 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357968  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0974  hypothetical protein  38.1 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.187621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1747  hypothetical protein  38.1 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1526  hypothetical protein  38.1 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238585  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3679  hypothetical protein  33.78 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.243952 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1675  hypothetical protein  34.38 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000169568  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1724  hypothetical protein  40 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1903  hypothetical protein  40 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1442  hypothetical protein  36.84 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0490295  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2677  hypothetical protein  37.75 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0956  hypothetical protein  35.17 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1363  hypothetical protein  33.57 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131173  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1084  hypothetical protein  42.55 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2126  hypothetical protein  30.47 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.141627 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2092  hypothetical protein  35.58 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000213437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2579  hypothetical protein  39.5 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109298  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3681  hypothetical protein  35.92 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.235304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>