21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4009 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4009  gas vesicle K  100 
 
 		 135 aa  257  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4699  Gas vesicle K  43.18 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2406  gas vesicle K  40 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.664539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2341  gas vesicle K  39.13 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2388  gas vesicle K  39.13 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2382  gas vesicle K  39.13 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3389  gas vesicle K  38.89 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0706  hypothetical protein  34.12 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6862  hypothetical protein  36.67 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1801  Gas vesicle K  30.59 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2348  Gas vesicle K  37.93 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1261  gas vesicle protein K  35.71 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.16105  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0340  Gas vesicle K  42.17 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2827  hypothetical protein  32.39 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0072  gas vesicle K  33.8 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349915  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3257  gas vesicle K  34.29 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.224981 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3575  putative gas vesicle synthesis protein  34.29 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1487  gas vesicle K  33.33 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.48089  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0337  hypothetical protein  34.62 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2368  Gas vesicle K  36.28 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2332  gas vesicle K  26.25 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>