119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2671 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2671  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  427  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4120  transposase, IS4  68.75 
 
 
390 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6377  transposase IS4 family protein  70.31 
 
 
395 aa  101  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2810  transposase IS4 family protein  70.31 
 
 
395 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3073  transposase IS4 family protein  50.51 
 
 
367 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4211  transposase, IS4  54.55 
 
 
310 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0672  transposase, IS4  44.62 
 
 
433 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1189  transposase, IS4  44.62 
 
 
433 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.944159  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1776  transposase, IS4  44.62 
 
 
433 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1962  transposase, IS4  44.62 
 
 
433 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762246  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2052  transposase, IS4  44.62 
 
 
433 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.460189  normal  0.19863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2330  transposase, IS4  44.62 
 
 
433 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2481  transposase, IS4  44.62 
 
 
433 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650246  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2704  transposase, IS4  44.62 
 
 
433 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2799  transposase, IS4  44.62 
 
 
433 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2941  transposase, IS4  44.62 
 
 
433 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3313  transposase, IS4  44.62 
 
 
433 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4115  transposase, IS4  44.62 
 
 
433 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4218  transposase, IS4  44.62 
 
 
433 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.378092  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4220  transposase, IS4  44.62 
 
 
433 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0300  transposase, IS4  44.62 
 
 
409 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.563968  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0392  transposase, IS4  34.09 
 
 
390 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1119  transposase, IS4  34.09 
 
 
390 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2121  transposase, IS4  34.09 
 
 
390 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2058  hypothetical protein  41.07 
 
 
173 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00443479  normal  0.186203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0994  transposase, IS4 family protein  41.03 
 
 
395 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5320  hypothetical protein  47.54 
 
 
437 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621577  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5311  putative transposase  47.54 
 
 
415 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0119  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0149  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0202  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0303  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0682855  hitchhiker  0.000916008 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0309  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0471635  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0738  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136372 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0946  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1128  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.588687  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1208  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580932  hitchhiker  0.00000329494 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1487  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431301  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1510  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1512  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1765  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2080  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111735  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2131  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0176803 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2134  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0202334 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2180  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000540383 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2331  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.616307  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2395  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2427  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.383044  hitchhiker  0.00036202 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2581  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2773  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2788  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896151  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2797  hypothetical protein  44.32 
 
 
439 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0118  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0150  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0201  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0304  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0856099  hitchhiker  0.00019889 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0308  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00145188  decreased coverage  0.0000198477 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0737  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0945  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1127  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.418857  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1209  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000367685 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1511  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.673335  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1766  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.398767  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2081  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2130  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0125473 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2135  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0139526 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2181  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000268633 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2330  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2396  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2426  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.67588  hitchhiker  0.000659756 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2580  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2772  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2789  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2798  transposase, IS4  40 
 
 
104 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1595  transposase IS4 family protein  45.16 
 
 
483 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0296  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0443  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0569  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.228181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0572  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3866  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000448202 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0597  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0603  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2785  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.738177  normal  0.743727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2609  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.720943  hitchhiker  0.00290124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0564  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.561014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2564  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000012164  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2329  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0102713  hitchhiker  0.000965394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0098  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0101  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0170  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0172  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0548  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0595  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0630  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0643  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0766  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0994  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.416705  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1228  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1271  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1300  transposase IS4 family protein  32 
 
 
369 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.406544  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>