178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1351 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1351  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 151 aa  293  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10853  transposase  42.72 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.71857e-46  hitchhiker  0.0000000080045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11347  transposase  42.72 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.3772600000000003e-34  normal  0.888349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11740  transposase  42.72 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.53193e-56  normal  0.308652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11774  transposase  42.72 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.9098299999999996e-43  hitchhiker  0.00000000075724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11781  transposase  42.72 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.66965e-85  hitchhiker  0.000000000569119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11784  transposase  42.72 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.00725e-90  hitchhiker  0.0000000133913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11791  transposase  42.72 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.324620000000001e-61  hitchhiker  0.00000385538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11807  transposase  42.72 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.601339999999999e-45  hitchhiker  0.00672447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12049  transposase  42.72 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.40799e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12113  transposase  42.72 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.72555e-57  normal  0.924844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12377  transposase  42.72 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.02474e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12380  transposase  42.72 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.5215000000000001e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12417  transposase  42.72 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.85202e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12829  transposase  42.72 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.40646e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13131  transposase  42.72 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000102607  normal  0.123533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13207  transposase  42.72 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.838360000000001e-28  normal  0.797381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13358  transposase  42.72 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.49743e-39  normal  0.534479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1203  transposase IS3/IS911 family protein  41.75 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2529  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000311757  hitchhiker  0.00296744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3482  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265992  hitchhiker  0.00308131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3607  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00876611  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1239  transposase IS3/IS911 family protein  46.84 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5654  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5988  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000845611 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5443  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5432  transposase IS3/IS911  40 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.115544 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5829  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.342164 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5601  transposase IS3/IS911  39.25 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6002  transposase IS3/IS911 family protein  39.25 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000711123 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2226  transposase IS3/IS911  42.31 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2045  transposase IS3/IS911 family protein  43.02 
 
 		 89 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00952003  normal  0.01022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  36.05 
 
 		 109 aa  57  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  36.05 
 
 		 109 aa  57  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17790  Transposase  36.54 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.837137  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2587  hypothetical protein  47.06 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000140598  hitchhiker  0.000388749 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0063  transposase IS3/IS911 family protein  36.19 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  38.46 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2223  transposase IS3/IS911 family protein  39.53 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.055564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  38.46 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  38.46 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0077  putative transposase family protein  38.89 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.302219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  36.05 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  36.05 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  32.97 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8280  hypothetical protein  35.11 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  39.77 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  39.77 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8266  hypothetical protein  36.05 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0929  transposase IS3/IS911  36.9 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  31.87 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0946  Fis family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0053  IS629, transposase orfA  37.36 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2593  transposase IS3/IS911  36.9 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1483  Fis family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2637  Fis family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0600  Fis family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15110  Transposase  36.59 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.156144  normal  0.993189 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4772  IS1203 transposase orfA  36.26 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371432  normal  0.791155 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3231  IS629, transposase orfA  36.26 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172275  hitchhiker  0.000705402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1177  IS629, transposase orfA  36.26 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0292  IS629, transposase orfA  36.26 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.642874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3515  IS629, transposase orfA  36.26 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0406871 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0042  IS629, transposase orfA  36.26 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1169  IS629, transposase orfA  36.26 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.481035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3385  IS629, transposase orfA  36.26 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1656  IS629, transposase orfA  36.26 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2844  IS629, transposase orfA  36.26 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.865071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2933  IS629, transposase orfA  36.26 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  hitchhiker  0.0000000000000376997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2788  IS629, transposase orfA  36.26 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.253032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2285  IS629, transposase orfA  36.26 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  hitchhiker  0.00000000000000192514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4590  IS629, transposase orfA  36.26 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3873  IS629, transposase orfA  36.26 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.997702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1217  transposase IS3/IS911 family protein  32.38 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  31.71 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0014  IS629, transposase orfA  38.71 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4440  transposase IS3/IS911 family protein  30.12 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5065  transposase IS3/IS911 family protein  30.12 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5345  transposase IS3/IS911 family protein  30.12 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5556  transposase IS3/IS911 family protein  30.12 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1861  transposase IS3/IS911  33.33 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  33.01 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  33.01 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  35.9 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  30.84 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0036  IS629, transposase orfA  37.36 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  30.23 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  30.23 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2491  IS629, transposase orfA  37.36 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.99232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  30.23 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2666  IS629, transposase orfA  37.36 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331331 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  30.23 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  30.23 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2154  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2259  IS629 transposase orfA  37.36 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>