30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1088 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1088  metallophosphoesterase  100 
 
 
324 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2235  metallophosphoesterase  64.91 
 
 
292 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336195  normal  0.178546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2094  metallophosphoesterase  65.38 
 
 
293 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443095  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0497  metallophosphoesterase  66.3 
 
 
279 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1505  metallophosphoesterase  65.33 
 
 
291 aa  364  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2617  metallophosphoesterase  66.91 
 
 
279 aa  360  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0457152  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3411  metallophosphoesterase  62.68 
 
 
292 aa  351  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.964336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3806  Ser/Thr protein phosphatase family protein  63.77 
 
 
279 aa  345  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0262444  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5285  metallophosphoesterase  61.69 
 
 
281 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696837  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12808  hypothetical protein  57.29 
 
 
324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000280695  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2076  metallophosphoesterase  58.39 
 
 
320 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0272724  normal  0.436054 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2139  metallophosphoesterase  58.39 
 
 
320 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0227605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2093  metallophosphoesterase  58.39 
 
 
320 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2327  metallophosphoesterase  60 
 
 
315 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0203181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1725  metallophosphoesterase  58.7 
 
 
328 aa  317  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4030  metallophosphoesterase  58.8 
 
 
315 aa  316  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2156  metallophosphoesterase  58.46 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22230  predicted phosphohydrolase  56.2 
 
 
276 aa  282  5.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484241  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0170  metallophosphoesterase  53.46 
 
 
289 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.76404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2453  hypothetical protein  28.52 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28127  predicted protein  28.22 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.16842  normal  0.161123 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1678  serine/threonine protein phosphatase family protein  33.33 
 
 
253 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.854416  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33447  predicted protein  35.35 
 
 
359 aa  52.8  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47431  predicted protein  25.78 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2512  hypothetical protein  22.46 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2463  hypothetical protein  22.46 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00247056  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1429  hypothetical protein  19.79 
 
 
575 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00343203  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2016  hypothetical protein  21.09 
 
 
269 aa  47  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00320612  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0687  metallophosphoesterase  19.26 
 
 
288 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  30.29 
 
 
258 aa  43.1  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>