33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2016 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2016  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  558  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00320612  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2512  hypothetical protein  54.17 
 
 		 275 aa  316  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2463  hypothetical protein  54.17 
 
 		 275 aa  316  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00247056  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1056  phosphohydrolase  29.57 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0306  phosphohydrolase  26.09 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0687  metallophosphoesterase  27.74 
 
 		 288 aa  85.9  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1105  hypothetical protein  27.89 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000289527  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0515  hypothetical protein  28.46 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2453  hypothetical protein  25.1 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0278  metallophosphoesterase  23.4 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000290952  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2872  metallophosphoesterase  24.7 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2606  metallophosphoesterase  23.77 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3411  metallophosphoesterase  22.14 
 
 		 292 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.964336 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1678  serine/threonine protein phosphatase family protein  23.64 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.854416  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22230  predicted phosphohydrolase  21.13 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484241  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47431  predicted protein  27.56 
 
 		 412 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2617  metallophosphoesterase  21.58 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0457152  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2235  metallophosphoesterase  22.43 
 
 		 292 aa  49.3  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336195  normal  0.178546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0497  metallophosphoesterase  22.9 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1088  metallophosphoesterase  21.09 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0170  metallophosphoesterase  22.3 
 
 		 289 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.76404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1505  metallophosphoesterase  22.41 
 
 		 291 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2094  metallophosphoesterase  22.05 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443095  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  23.65 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1579  metallophosphoesterase  20.58 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  33.72 
 
 		 381 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  35 
 
 		 420 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  32.73 
 
 		 361 aa  43.5  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  28.57 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1997  metallophosphoesterase  25.78 
 
 		 252 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654856  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  20.54 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0572  metallophosphoesterase  36.71 
 
 		 376 aa  42.4  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4744  metallophosphoesterase  26.83 
 
 		 299 aa  42  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.158443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>